肛肠科由我国著名肛肠外科专家吴佐周主任医师主持肛肠科工作，肛肠科可用中西医结合的理论和方法治疗全国各地肛肠疾病治疗后导致的后遗症。对炎症性肠病如：溃疡性结肠炎、克隆氏病用中药和手术方法治疗积累了丰富的经验，对排便障碍性疾病如：结肠、直肠、肛门肛管出口及盆腹腔脏器、盆底解剖异常或生理功能下降、失调所致的各种“便秘”，用手术或药物治疗疗效达到国内外先进水平。吴佐周主任医师在肠癌研究治疗方面有新的建树，如中低位直肠癌保肛术后有满意的控便功能，结肠代直肠三腔扩肠腔水囊和保肛术的“多功能直肠癌肛术环功器”获国家专利，已在临床应用，以根治术为主配合防化疗使直肠癌5年存活率达到国际水平，曾荣获4项科研成果和科技进步奖。